通常情況下純化水制備系統的工藝配置方式根據地域和水源的不同而不同，純化水制備系統應根據不同的原水水質情況進行分析與計算，然后配置相應的組件來依次把各指標處理到允許的范圍之內。目前在國內純化水制備系統的主要工藝方式如下所示：

1、預處理系統工藝流程：自來水進水→原水箱→原水泵→多介質過濾器→活性炭過濾器→軟化過濾器→保安過濾器。自來水經預處理處理后達到RO反滲透系統的進水要求。

2、反滲透系統工藝流程：①工藝：預處理系統→一級高壓泵→一級RO反滲透→級間純水箱→二級高壓泵→二級RO反滲透→無菌純水箱。

②工藝：預處理系統→一級高壓泵→一級RO反滲透→級間純水箱→二級高壓泵→二級RO反滲透→二級純水箱→EDI輸送泵→EDI電除鹽系統→無菌純水箱。

③工藝：預處理系統→一級高壓泵→一級RO反滲透膜→純水箱→EDI輸送泵→EDI電除鹽系統→無菌純水箱。以上工藝去除水中的各種離子，微生物，產水水質符合藥典要求。

3、滅菌及輸送分配系統

滅菌工藝：無菌純水箱→UV紫外滅菌儀→0.22μm終端過濾器→出水口；

滅菌工藝：無菌純水箱→臭氧滅菌裝置→UV紫外滅菌儀→0.22μm終端過濾器→出水口→連接輸送管道；

可選擇消毒方式：活性炭巴氏消毒、CIP清洗系統、分配系統臭氧殺菌、分配系統巴氏消毒、分配系統純蒸汽殺菌。